此外，德隆事件中，吴晓灵的另一个重要贡献就是促成了第三方存管制度的建立。此前，不少证券公司存在挪用客户资产的情况，并形成了巨大的资金黑洞。而填补黑洞的工作，落到了人民银行头上。这位副局长说：“当时我们坚持一点，凡是关闭的证券公司，需要动用人民银行再贷款的，一律要实行第三方存管，不实行第三方存管的，我们不给补保证金。对于这一点，吴行长的态度十分坚决。”

　　这项制度的确立，使得监管机构从过去的“花钱买平安”彻底过渡到了“花钱买机制”。现在，“第三方存管机制”已写入《证券法》，其制度存在的优势和必要性得到了充分体现。

　　支持私募股权基金健康发展

　　作为刚刚进入中国的新兴事物，私募股权基金在被社会认可方面，得到了吴晓灵的大力推动。她多次强调，中国当前的经济环境，已经能够适应私募股权基金的发展，并在多个场合公开表示支持发展私募股权投资基金。

　　正是在吴晓灵等人的推动下，2007年9月16日，中国第一个私募股权投资基金协会在天津正式成立。吴晓灵对于发展私募股权基金观点鲜明，她认为，私募股权基金应当是在监管豁免条款下生存，重要的是规定合格投资人的标准。她的这一观点，也得到了包括渤海产业基金筹备组组长陈宗胜等圈内人士的一致认可。

　　在私募股权投资基金的发展获得社会重视之后，吴晓灵又开始从细微处入手，呼吁完善私募股权基金的制度建设，呼吁引导来华外资股权基金更多利用人民币市场，呼吁成立人民币股权基金。

　　现有的政策限制，使得证监会暂不能受理信托公司持股的企业上市，这为信托制的基金退出带来了困难。吴晓灵因此又成为第一个提出“应尽早明确信托模式的特殊退出问题”的官员。

　　一位信托公司的人士对记者表示，“我们等这一天已经等了很久，一直希望有人能帮我们呼吁一下。”吴晓灵的表态和她在私募股权基金界的影响力，让信托公司的心中燃起了希望。

　　中国小额信贷的有力推动者

　　作为农村金融改革的重要推动者之一，吴晓灵曾明确指出，农村金融改革是一个系统工程，必须整体推进农村金融改革，才能建立健全的农村金融体系。

　　在完善农村金融体系的大框架下，发展贴近农户的小额信贷是对农村金融体系的重要补充。此前农户的小规模信贷主要来自农信社，而规模庞大的民间金融却被排斥在外。在与人民银行研究局相关领导多次考察调研后，吴晓灵提出了发展小额贷款公司的框架性意见。而随后，人民银行相继推动地方政府批准了7家只贷不存的小额贷款公司。为民间金融“阳光化”迈出了重要的一步。

　　一位小额贷款公司的副总裁在一次小额信贷研讨会上对记者表示，他们十分感谢吴晓灵，因为正是她的力推，才有了小额贷款公司的今天。

　　吴晓灵为小额信贷组织获得合法身份的奔走如今看到了成果，在多个部门的协作下，小额贷款公司已有望获得金融牌照，向村镇银行和贷款公司转型。上海证券报