男性生殖器官分内外两部分。内生殖器由生殖腺（睾丸）、输精管道（附睾、输精管、射精管、男性尿道）和附属腺（精囊、前列腺、尿道球腺）组成。男性外生殖器为阴茎和阴囊，前者是男性性交接的器官，后者容纳睾丸和附睾。这些器官在青春期前发育非常缓慢，进入青春期后，在性激素的作用下，开始迅速发育，其速度远远超过其他系统。

      青春期男孩外生殖器的发育一般从12岁左右开始。这一时期，睾丸和阴囊开始增大，阴囊颜色渐渐变深，并逐渐长出浓密的阴毛。一般经过3年左右的时间，阴茎增长，直径增加，直至性发育成熟。青春期开始，由于阴茎迅速增大增粗，包皮渐渐向后退而露出龟头。如果青春期发育后包皮仍然包着龟头，需要翻动后才能露出者，称为包皮过长；若不能翻出来的，叫做包茎，需要手术治疗。包皮内常积存有包皮垢，在青春发育期，由于包皮垢产生比较多，应当经常翻过包皮洗一洗，以免引起龟头和包皮发炎。睾丸是男性生殖器最重要的一部分，是一对卵圆形的腺体。睾丸大小在青春期前略大于婴儿期，进入青春期后，睾丸迅速发育，容积增大，并能产生精子。睾丸不分泌雄性激素，因此睾丸既是生殖器官，也是内分泌器官。

      男孩生殖器官的附属腺在青春发育开始后均迅速发育并分泌液体，其与精子混合后形成精液。男性青少年有时会在熟睡时从尿道中排出黏稠的乳白色液体，即为精液，这一现象就是遗精，是男性特有的生理现象，是青春期发育的重要标志。男孩首次遗精年龄平均为１４～１６岁，比女孩月经初潮平均年龄约晚２年。初期的精液里可能没有成熟的精子。首次遗精发生后体格发育渐趋缓慢，而睾丸、附睾及阴茎却在迅速发育，接近成人水平。青春期男性，随着生殖器官发育，出现第二性征如毛发（阴毛、腋毛及胡须）生长、变声及出现喉结等。阴毛最先出现，其次是腋毛。腋毛出现１年后，长出胡须。喉结的突出是男性特有的第二性征。